Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprtQ99M80 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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