Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms