Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Clcc1Q99LI2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcc1Q99LI2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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