Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms