Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99KU6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99KU6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q99KU6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99KU6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms