Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms