Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms