Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms