Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms