Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tlcd1Q99JT6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms