Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms