Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Ddb2Q99J79 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ddb2Q99J79 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ddb2Q99J79 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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