Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ophn1Q99J31 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms