Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Smim11aQ99J19 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim11aQ99J19 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim11aQ99J19 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim11aQ99J19 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Smim11aQ99J19 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Smim11aQ99J19 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Smim11aQ99J19 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Smim11aQ99J19 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim11aQ99J19 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Smim11aQ99J19 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms