Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms