Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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