Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrif1Q923B3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms