Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms