Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms