Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms