Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms