Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms