Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms