Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms