Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul7Q8VE73 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul7Q8VE73 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul7Q8VE73 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul7Q8VE73 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul7Q8VE73 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul7Q8VE73 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul7Q8VE73 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul7Q8VE73 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms