Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a20aQ8VDB9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Slc6a20aQ8VDB9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Slc6a20aQ8VDB9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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