Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms