Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpap2Q8VC34 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpap2Q8VC34 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms