Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim29Q8R2Q0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms