Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms