Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms