Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw1Q8K4P8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms