Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mkl1Q8K4J6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms