Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot6Q8K3P5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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