Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vrk3Q8K3G5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Vrk3Q8K3G5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Vrk3Q8K3G5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Vrk3Q8K3G5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Vrk3Q8K3G5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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