Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms