Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl47Q8K2Y7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms