Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm48Q8K2X2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm48Q8K2X2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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