Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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FgbQ8K0E8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FgbQ8K0E8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms