Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d5Q8JZW5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms