Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Afg3l2Q8JZQ2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms