Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms