Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Card11Q8CIS0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Card11Q8CIS0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Card11Q8CIS0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Card11Q8CIS0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Card11Q8CIS0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Card11Q8CIS0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Card11Q8CIS0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Card11Q8CIS0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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Card11Q8CIS0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Card11Q8CIS0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Card11Q8CIS0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms