Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc43a2Q8CGA3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms