Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE8

Fbxw17, F-box and WD-40 domain protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw17Q8CFE8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fbxw17Q8CFE8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fbxw17Q8CFE8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fbxw17Q8CFE8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fbxw17Q8CFE8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fbxw17Q8CFE8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fbxw17Q8CFE8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw17Q8CFE8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms