Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hpf1Q8CFE2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hpf1Q8CFE2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hpf1Q8CFE2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hpf1Q8CFE2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hpf1Q8CFE2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hpf1Q8CFE2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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