Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms