Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx8Q8CFD4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx8Q8CFD4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx8Q8CFD4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx8Q8CFD4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx8Q8CFD4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx8Q8CFD4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx8Q8CFD4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx8Q8CFD4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx8Q8CFD4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms