Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms