Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDT7

Cabcoco1, Ciliary-associated calcium-binding coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabcoco1Q8CDT7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cabcoco1Q8CDT7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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